Toto středisko vzniklo na základě Opatření o zřízení ke dni 1. ledna 2004. Navázalo svou činností na stehnojmennou příspěvkovou organizaci, která působila v této oblasti. Koordinační středisko pro resortní zdravotnické informační systémy zajišťuje plnění úkolů Ministerstva zdravotnictví v oblasti zdravotnické informatiky. Především se jedná o zavádění, rozvoj a provoz určených informačních systémů.